西藏解放后，宗人民解放委员会于1956年6月设司法科兼理检察职能。1979年1月，芒康县人民检察院正式组建。组建以来，在县委和上级院的正确领导下，历届9任检察长带领全院检察干警艰苦奋斗、励精图治、与时俱进、不断发展，于2013年实现了整体搬迁，基层检察规范化建设明显提高、干警工作生活环境明显改善。

    根据中共西藏自治区委员会机构编制委员会办公室关于印发《昌都市基层人民检察院内设机构改革方案》（藏机编办发〔2021〕6号）的通知，现我院共设第一检察部、第二检察部、第三检察部、第四检察部、检察综合部5个部门；核定政法专项编制为22人（其中院领导职数3人，检委会专职委员1人（副科级），内设机构领导职数6人，派驻检察室领导职数1人（副科级）），实有干警21人，另有聘用制书记员5人。